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绵羊夏柏特线虫和叶氏夏柏特线虫线粒体nad5基因和cytb基因的序列分析 被引量:2
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作者 赵雷 江海 +5 位作者 刘国华 赵光辉 蔡进忠 周东辉 朱兴全 钱爱东 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期21-26,共6页
本研究的目的是通过对绵羊夏柏特线虫和叶氏夏柏特线虫线粒体细胞色素b基因(cytb)部分序列(pcytb)和烟酰胺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位5基因(nad5)部分序列(pnad5)的克隆和遗传变异分析,首次为在分子水平上区分绵羊夏柏... 本研究的目的是通过对绵羊夏柏特线虫和叶氏夏柏特线虫线粒体细胞色素b基因(cytb)部分序列(pcytb)和烟酰胺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位5基因(nad5)部分序列(pnad5)的克隆和遗传变异分析,首次为在分子水平上区分绵羊夏柏特线虫和叶氏夏柏特线虫提供理论依据。采用PCR方法分别克隆了6条绵羊夏柏特线虫陕西分离株和9条叶氏夏柏特线虫青海分离株的pcytb和pnad5。将测序结果应用ClustalX1.81程序进行比对,然后用PAUP4.0程序中的MP法将pcytb和pnad5串联后构建系统发育树。结果显示,获得的pnad5和pcytb序列的长度分别为388bp和659bp,其变异率在绵羊夏柏特线虫分离株中分别为0.3%~1.3%和0.2%~2.6%,在叶氏夏柏特线虫分离株中分别为0~1.8%和0.2%~1.2%,较为保守。但pnad5和pcytb序列在两种间差异率较大,分别为14.7%~16.0%和15.0%~17.39/6。用pcytb和pnad5串联后的序列进行的种系发育分析表明,绵羊夏柏特线虫和叶氏夏柏特线虫分别位于2个分支,支持叶氏夏柏特线虫为独立种;pcytb和pnad5序列可作为夏柏特线虫种间鉴定的遗传标记。 展开更多
关键词 绵羊夏柏特线虫 叶氏夏柏特线虫 线粒体DNA nad5基因 CYTB基因 种系发育分析
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绵羊夏柏特线虫线粒体pcox1基因的克隆及序列分析 被引量:2
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作者 赵雷 江海 +3 位作者 赵光辉 刘国华 朱兴全 钱爱东 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期539-542,共4页
以从陕西省泾阳县山羊大肠中采集的5条绵羊夏柏特线虫为研究对象,用通用引物JB3及JB4.5扩增绵羊夏柏特线虫的线粒体细胞色素c氧化酶第1亚基(cox1)基因部分序列(pcox1),将测序获得的序列用ClustalX 1.81程序进行比对,并用PAUP程序MP法构... 以从陕西省泾阳县山羊大肠中采集的5条绵羊夏柏特线虫为研究对象,用通用引物JB3及JB4.5扩增绵羊夏柏特线虫的线粒体细胞色素c氧化酶第1亚基(cox1)基因部分序列(pcox1),将测序获得的序列用ClustalX 1.81程序进行比对,并用PAUP程序MP法构建系统发育树。结果表明:所获得的5个绵羊夏柏特线虫样品pcox1序列长度均为393 bp;种系发育分析表明,绵羊夏柏特线虫5个样品位于同一分支,且绵羊夏柏特线虫的pcox1序列种内相对保守(0.5%~2.0%),种间变异显著(9.4%~18.8%),pcox1序列可作为种间变异研究的可靠遗传标记。 展开更多
关键词 绵羊夏柏特线虫 线粒体DNA pcox1基因 种系发育关系
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猪源弓形虫的分离鉴定及基因型的研究 被引量:2
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作者 江海 邓舜洲 +4 位作者 高洋根 张文波 万文忠 蒋新华 朱兴全 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期453-457,共5页
本研究的目的是分离鉴定江西省某猪场猪感染的弓形虫虫株并研究其多位点基因型。以江西省某猪场病死的后备母猪肺门淋巴结为材料,经触片、瑞氏染色,镜检可见弓形虫滋养体;将该阳性病料腹腔接种BALB/c小鼠,经连续传代分离得到弓形虫虫株... 本研究的目的是分离鉴定江西省某猪场猪感染的弓形虫虫株并研究其多位点基因型。以江西省某猪场病死的后备母猪肺门淋巴结为材料,经触片、瑞氏染色,镜检可见弓形虫滋养体;将该阳性病料腹腔接种BALB/c小鼠,经连续传代分离得到弓形虫虫株(命名为TgPJX13),用基于B1基因的半巢式PCR方法对该分离虫株进行鉴定,得到弓形虫的特异条带。测序表明,TgPJX13株扩增片段序列与NCBI中的弓形虫B1基因序列完全一致。用PCR-RFLP方法在11个基因位点(其中SAG1、SAG2、SAG3、5′+3′SAG2、BTUB、GRA6、c22-8、c29-2、L358和PK1为核基因位点,Apico为顶质体基因位点)对TgPJX13虫株进行基因型鉴定,确定该虫株的基因型为ToxoDB#9。弓形虫TgPJX13株的成功分离和鉴定为进一步研究其毒力及生物学特性奠定了基础。 展开更多
关键词 弓形虫 江西 虫株分离 基因型鉴定
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鸭肝炎病毒CQ株基因组5'端非编码区的克隆与测序分析
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作者 高继业 江海 +3 位作者 汪军卿 陈苏鸿 黄伟 谢立飞 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第5期132-134,共3页
鸭肝炎(duckheptitis,DH)是雏鸭的一种急性、高度接触性、致死性传染病,其病原为鸭肝炎病毒(Duckhepatitisvirus,DnV)。传统分类法将DHV分为3种血清型,即血清I型、Ⅱ型、Ⅲ型,其中血清I型属于小RNA病毒科,而血清Ⅱ型、Ⅲ型均... 鸭肝炎(duckheptitis,DH)是雏鸭的一种急性、高度接触性、致死性传染病,其病原为鸭肝炎病毒(Duckhepatitisvirus,DnV)。传统分类法将DHV分为3种血清型,即血清I型、Ⅱ型、Ⅲ型,其中血清I型属于小RNA病毒科,而血清Ⅱ型、Ⅲ型均属于星状病毒科,因此有学者将DHV分为血清I型、台湾新型和韩国新型,分别对应于基因A型、B型和C型。 展开更多
关键词 鸭肝炎病毒 测序分析 非编码区 克隆 小RNA病毒 血清Ⅱ型 血清型 DHV
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