目的:通过芯片分析联合网络药理学及其实验验证,阐明淫羊藿干预乳腺癌干细胞(BCSCs)的潜在分子标志物和药物-化合物-靶点机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索相关药物信息,获得淫羊藿的活性成分和潜在靶点。在基因...目的:通过芯片分析联合网络药理学及其实验验证,阐明淫羊藿干预乳腺癌干细胞(BCSCs)的潜在分子标志物和药物-化合物-靶点机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索相关药物信息,获得淫羊藿的活性成分和潜在靶点。在基因表达综合(GEO)数据库检索"Breast Cancer Stem Cells",通过分析与筛选,获取GSE98239芯片数据,使用GEO2R在线分析工具获取其差异基因,绘制差异基因热图和火山图。通过Cytoscape 3.8.0构建淫羊藿干预乳腺癌干细胞差异基因网络图,并进行药物与疾病基因的基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。将人乳腺癌MDAMB-231细胞分为20%,40%,60%淫羊藿含药血清组和对照组,通过细胞增殖与活性检测(CCK-8),蛋白免疫印迹法(Western blot)检测淫羊藿含药血清干预MDA-MB-231后,对其活性和乳腺癌细胞中靶蛋白表达量的影响。结果:获得淫羊藿含有的黄酮、甾醇、生物碱及倍半萜类活性成分23个,发现其与乳腺癌干细胞中的B细胞淋巴瘤-2样蛋白1(BCL2L1),基质金属蛋白酶2(MMP2),人前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2),血管内皮生长因子(VEGF)A,转化生长因子β受体Ⅰ(TGFBR1)等枢纽基因相互作用,参与诱导新的血管生成、细胞迁移,使BCSCs持续自我更新而凋亡减少并发生细胞迁移,从而促进乳腺癌的复发和转移。KEGG结果显示,淫羊藿干预pathway in cancer信号通路中转化生长因子β(TGF-β),VEGF,胞内磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt),丝裂原活化蛋白激酶(MAPK),哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)亚通路的多个差异表达基因(DEGs)来发挥其干预乳腺癌干细胞的功效。实验表明,淫羊藿含药血清干预后乳腺癌细胞存活率显著降低,乳腺癌细胞中TGFBR1和Smad2表达量显著降低(P<0.01)。结论:淫羊藿不同浓度含药血清中的多个组分,能够协同作用于乳腺癌干细胞的目标差异表达基因,并�展开更多
文摘目的:通过芯片分析联合网络药理学及其实验验证,阐明淫羊藿干预乳腺癌干细胞(BCSCs)的潜在分子标志物和药物-化合物-靶点机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索相关药物信息,获得淫羊藿的活性成分和潜在靶点。在基因表达综合(GEO)数据库检索"Breast Cancer Stem Cells",通过分析与筛选,获取GSE98239芯片数据,使用GEO2R在线分析工具获取其差异基因,绘制差异基因热图和火山图。通过Cytoscape 3.8.0构建淫羊藿干预乳腺癌干细胞差异基因网络图,并进行药物与疾病基因的基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。将人乳腺癌MDAMB-231细胞分为20%,40%,60%淫羊藿含药血清组和对照组,通过细胞增殖与活性检测(CCK-8),蛋白免疫印迹法(Western blot)检测淫羊藿含药血清干预MDA-MB-231后,对其活性和乳腺癌细胞中靶蛋白表达量的影响。结果:获得淫羊藿含有的黄酮、甾醇、生物碱及倍半萜类活性成分23个,发现其与乳腺癌干细胞中的B细胞淋巴瘤-2样蛋白1(BCL2L1),基质金属蛋白酶2(MMP2),人前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2),血管内皮生长因子(VEGF)A,转化生长因子β受体Ⅰ(TGFBR1)等枢纽基因相互作用,参与诱导新的血管生成、细胞迁移,使BCSCs持续自我更新而凋亡减少并发生细胞迁移,从而促进乳腺癌的复发和转移。KEGG结果显示,淫羊藿干预pathway in cancer信号通路中转化生长因子β(TGF-β),VEGF,胞内磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt),丝裂原活化蛋白激酶(MAPK),哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)亚通路的多个差异表达基因(DEGs)来发挥其干预乳腺癌干细胞的功效。实验表明,淫羊藿含药血清干预后乳腺癌细胞存活率显著降低,乳腺癌细胞中TGFBR1和Smad2表达量显著降低(P<0.01)。结论:淫羊藿不同浓度含药血清中的多个组分,能够协同作用于乳腺癌干细胞的目标差异表达基因,并�
